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雙胍類〈biguanides類〉降血糖藥品在治療初期，最常見的副作用發生在腸胃道方面，如食慾不振、噁心、嘔吐、下痢及腹痛等。
患者可隨餐服用以減低不適；長期服用此藥後維生素B12 與葉酸的吸收均會降低，特別在老年人有可能造成貧血的危險。雖然累積近四十年來僅有五個巨母紅血球貧血（megaloblastic anemia）的案例報告，但固定使用biguanide的患者仍宜每年定期追蹤檢查。
幾乎所有的研究報告都顯示目前市面上的biguanide乳酸中毒的發生率極低，但乳酸中毒依就是這類藥物最令人憂心的問題，回顧歷年來biguanide引起乳酸中毒的案例，發現其中常合併其它疾病，如尿毒症、心肺功能不足、酒精中毒、肝腎功能極度不良等，所以臨床使用時上述患者應列為治療禁忌。
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