共軛亞麻油酸是不飽和脂肪酸的一種；脂肪酸是構成脂質的主成份，也是構成身體的基礎及成為熱量的重要營養素，脂肪酸依構造的不同分有飽和脂肪酸及不飽和脂肪酸，若攝取過多飽和脂肪酸，會增加血中膽固醇及中性脂肪，造成動脈硬化，反之，富含不飽和脂肪酸的脂肪被稱為是好的脂肪。

共軛亞麻油酸能防止可稱為生活習慣病元兇的「肥胖」，當脂肪在體內消化吸收後，會由一種叫作脂蛋白解脂的酵素幫助儲存，被儲存的脂肪會由荷爾蒙感受性解脂分解，轉變成熱量，若荷爾蒙感受性解脂無法發揮功效，脂肪就會愈積愈多，而共軛亞麻油酸能讓荷爾蒙感受性解脂活化。另外，因共軛亞麻油酸能減少血中膽固醇及中性脂肪，能改善血液循環與虛寒症，而其抗氧化功能能防止血中氧化低密度脂蛋白在血管的沈積，並抑制過敏反應，抑制會招致過敏的物質之生成。

共軛亞麻油酸能有效將體脂肪轉換為熱量，所以在運動前攝取最佳，另外，食物中能攝取到的共軛亞麻油酸屬於微量，故利用保健食品較有效。